信使RNA
信使RNA的功能就是把DNA上的遺傳信息精確無誤地轉錄下來，然后再由mRNA的堿基順序決定蛋白質的氨基酸順序，完成基因表過程中的遺傳信息傳遞過程。在真核生物中，轉錄形成的前體RNA中含有大量非編碼序列，大約只有25%序列經加工成為mRNA，最后翻譯為蛋白質。
核糖體RNA
rRNA是組成核糖體的主要成分，核糖體是合成蛋白質的工廠。在大腸桿菌中，rRNA量占細胞總RNA量的75%-85%，而tRNA占15%，mRNA僅占3-5%。
rRNA一般與核糖體蛋白質結合在一起，形成核糖體，如果把rRNA從核糖體上除掉，核糖體的結構就會發生塌陷。
轉運RNA
tRNA是分子最小的RNA，其分子量平均約為27000（25000-30000），由70到90個核苷酸組成。而且具有稀有堿基的特點，稀有堿基除假尿嘧啶核苷與次黃嘌呤核苷外，主要是甲基化了的嘌呤和嘧啶。這類稀有堿基一般是在轉錄后，經過特殊的修飾而成的。